校園新聞
多體超大蛋白質相互作用復合物結構的計算預測

發布日期:2020-10-08 字號:  點擊次數:

主講人:龔新奇 教授

主持人:崔學峰 教授

時間:2020年10月12日(星期一)16:00-17:00

地點:山東大學(青島)第周苑C座(N3)332會議室


主講人簡介:

龔新奇,中國人民大學數學科學研究院教授、博士生導師,數學智能應用課題組長,清華大學北京結構生物高精尖創新中心合作研究員,中國人民大學數學學院學位委員會委員、師德建設與監督委員會委員,哈佛大學、IBM公司訪問學者,中國計算機學會高級會員、生物信息學專業委員會員,中國生物信息學會(籌)理事,中國運籌學會計算系統生物學分會理事。研究方向為生物信息學和機器學習理論、方法和應用。已發表SCI論文62篇,被引2100多次,H指數22,發表期刊包括Nature/Science/PNAS/Proteins/Bioinformatics/ 中國科學/IEEE-ACM TCBB等。主持科研項目8個,包括國家自然科學基金面上項目、國家自然科學基金重點集成項目、國家重點實驗室開放課題等。


內容摘要:

在前期蛋白質-蛋白質分子對接研究的基礎上,結合近年實驗上因為冷凍電鏡技術革命而解析的更大多體蛋白質復合體,我的實驗室近來聚焦多體蛋白質相互作用的計算和預測。我們挖掘了多體蛋白質相互作用的幾何特征,發現了界面氨基酸配對的新規則,開發了預測兩體、三體和四體等蛋白質相互作用時的界面氨基酸配對的機器學習算法,構建了從單體蛋白質預測多體相互作用時氨基酸距離矩陣的深度學習架構。我們比較了多體蛋白質復合物中不同界面的差異,發現有些界面是重要的熱點界面,比其他界面更容易形成、作用更突出。


主辦單位:計算機科學與技術學院



【 作者:計算機科學與技術學院  來源:計算機科學與技術學院   責任編輯:劉芳 】

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